lunes, 23 de junio de 2025

“STAMP”: Un nuevo modelo de análisis transcriptómico que avizora una revolución tanto en la investigación básica como en la clínica


La reciente técnica STAMP (Single-cell Transcriptomics Analysis and Multimodal Profiling), diseñada por investigadores españoles, estadounidenses y australianos, bajo la dirección de Emanuele Pitino del Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG) en Bacerlona, y recientemente presentada en la reconocida revista científica Cell (2025), introduce una transformación radical en la forma de estudiar células individuales. Esta metodología innovadora permite analizar la expresión génica y proteica a nivel unicelular utilizando plataformas de imagen en lugar de secuenciación, lo que reduce drásticamente los costos y amplía la escalabilidad. STAMP fija ("estampa") las células en suspensión sobre portaobjetos compatibles con tecnologías de imagen como Xenium, CosMx o Phenocycler, permitiendo la captura simultánea de morfología celular, expresión de ARN y proteínas sin destruir la célula.

Más allá del ahorro económico, su capacidad para analizar millones de células en un solo experimento, detectar poblaciones celulares ultra-raras, y preservar la arquitectura celular le confiere ventajas invaluables tanto en investigación básica como en aplicaciones clínicas inmediatas. Por ejemplo, ha demostrado sensibilidad suficiente para identificar células tumorales circulantes simuladas diluidas 1 en 100,000 células sanguíneas, o resolver más de 30 estados inmunes distintos en muestras de sangre periférica. Además, STAMP se ha validado en estudios de diferenciación de células madre, inmunofenotipado a gran escala y estudios de respuesta celular a estímulos, mostrando una alta reproducibilidad y concordancia con secuenciación unicelular tradicional.

Invitamos a jóvenes investigadores a incorporar STAMP en sus estrategias experimentales. Esta tecnología no solo amplía la resolución del análisis celular, sino que democratiza el acceso a estudios unicelulares de gran volumen, antes limitados por los costos de secuenciación. STAMP ofrece una plataforma versátil para estudiar dinámicas celulares, explorar tratamientos personalizados y diseñar experimentos de perturbación multiplexada, todo con una robustez técnica y flexibilidad sin precedentes. Es, sin duda, una herramienta que cambiará la forma de hacer biología celular en la próxima década.

Quienes tengan mayor interés en el mencionado artículo: “STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging”, pueden hacerlo a través del siguiente enlace: https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00577-X

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